近来有报导指，中华民国前总统蒋经国在其日记提到，章亚若所生的双胞胎不是他的骨肉。这种说法引发争议。史丹福大学胡佛档案馆东亚部主任林孝庭5月31日表示，1940年代蒋经国日记里多处提到他对章亚若的爱，在章亚若即将临盆前夕，甚至一度准备向妻子蒋方良全盘吐实；美国的中央情报局也早在1980年代，就已认定蒋孝严是蒋经国之子。因此，蒋经国在日记中对于亲子关系未讲实话，应该是有其他考量。

林孝庭举例，蒋经国曾写说，一到没有上班的星期假日，“即自觉精神无寄托之处，心甚不定”，可见蒋对于不能与章亚若见面的痛苦。蒋经国也自认他爱章亚若乃“出于至诚，发于内心”，只是因为大环境因素，有许多对不起章亚若的地方。蒋经国多少心中有愧，并自问“不知其能谅我之苦心乎？”

林孝庭说，蒋经国在1942年初、章亚若即将临盆前夕，一度准备向妻子蒋方良吐实，认真考虑结束与蒋方良七年的婚姻。然而，他担心此举对于尚未成年的蒋孝文、蒋孝章的冲击，以及对两人前途上的影响。

但是又为何到了1954年，蒋经国的态度有如此大的转变？在日记中不认自己的骨肉？林孝庭认为，当时的蒋经国已位居国民党内权力接班梯队，内外政敌环伺下，不可能让早年这段无疾而终的婚外情成为政治更上一层楼的阻碍。此外，蒋经国也无法不考虑父亲蒋介石对于此事的观感，因而矢口否认他与章亚若的往事。

只是，既然是日记，何必欺骗；而且，在日记中欺骗，日记的信度也可能遭受质疑。

对此，林孝庭认为，日记作为历史研究的来源之一，具有强烈的个人主观性，本来就不等同于历史事实，必须参照其他各方档案资料对照佐证，才能拼凑出史实的原貌。他强调，蒋经国或许在某些敏感话题上，并未在日记里全盘吐实，然而，要说一个人连续43年，天天不断写日记来欺骗自己，“似乎也不合理”。

林孝庭并展示美国中央情报局1985年初一份标题名为“台湾政治继承”的机密文件。内容清楚指出时任外交部北美司长章孝严的父亲，就是中华民国总统蒋经国。林孝庭表示，当时蒋经国还在世，他与章亚若的婚外情仍是一个禁忌话题；神通广大的美国情报单位既已认定章孝严与蒋经国的骨肉关系，“这份解密档案或许可以提供我们思考此事的一个重要线索。”